Ballgown bridges the gap between transcriptome assembly and expression analysis
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Flexible analysis of transcriptome assemblies with Ballgown
A key advantage of RNA sequencing (RNA-seq) over hybridization-based technologies such as microarrays is that RNA-seq makes it possible to reconstruct complete gene structures, including multiple splice variants, from raw RNA-seq reads without relying on previouslyestablished annotations [20, 32, 9]. But with this added flexibility, there are increased computational demands on upstream processi...
متن کاملon the relationship between different discourse markers and information-gap and reasoning-gap tasks, and the effectiveness of input enhancement type of instruction on students acquisition of discourse markers.
abstract tasks nowadays are at the center of attention in sla research. task types is one of the critical issues in this regard, their effectiveness and suitability to any particular context, their characteristics and the result they yield are among some of these issues. on the other hand, discourse markers (dms) have been very much investigated and their effectiveness in conveying the meaning...
15 صفحه اولFlexible isoform-level differential expression analysis with Ballgown
We have built a statistical package called Ballgown for estimating differential expression of genes, transcripts, or exons from RNA sequencing experiments. Ballgown is designed to work with the popular Cufflinks transcript assembly software and uses well-motivated statistical methods to provide estimates of changes in expression. It permits statistical analysis at the transcript level for a wid...
متن کاملthe analysis of the role of the speech acts theory in translating and dubbing hollywood films
از محوری ترین اثراتی که یک فیلم سینمایی ایجاد می کند دیالوگ هایی است که هنرپیش گان فیلم میگویند. به زعم یک فیلم ساز, یک شیوه متأثر نمودن مخاطب از اثر منظوره نیروی گفتارهای گوینده, مثل نیروی عاطفی, ترس آور, غم انگیز, هیجان انگیز و غیره, است. این مطالعه به بررسی این مسأله مبادرت کرده است که آیا نیروی فراگفتاری هنرپیش گان به مثابه ی اعمال گفتاری در پنج فیلم هالیوودی در نسخه های دوبله شده باز تولید...
15 صفحه اولthe relationship between collocational competence and listening comprehension
پس از پیدایش روش تدریس tpr توسط جیمز اشر که توجه و تآکید بسیاری بر مهارت شنیداری داشت زبانشناسان همواره در صدد یافتن راههایی برای بهبود این مهارت در زبان آموزان می باشند. از طرفی جی-آر-فرث که از پیشگامان زبانشناسی می باشد بر تآثیر لغات و بویژه گروه کلمات که اغلب در گفتار با هم می آیند (هم آیی کلمات)تأکید بسیار کرده است. به این دلیل و به منظوربررسی رابطه بین این دو عامل یعنی درک شنیداری و دانش...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Nature Biotechnology
سال: 2015
ISSN: 1087-0156,1546-1696
DOI: 10.1038/nbt.3172